Episodes
1. Pas de quartier
Le Grand Rite est accompli, Salem est dévastée par la variole sans que personne n'en comprenne la cause. Mary qui a retrouvé son fils commence à nouer des liens parentaux. Cependant, la disparition de John la tourmente, elle décide donc de rendre visite à Petrus afin de connaître la triste vérité. John, de son côté, est soigné par les Indiens qui lui demandent de quitter ces terres où seule la Mort l'attend. Mais il refuse, souhaitant purger Salem de toutes les sorcières. Il se voit donc offrir des armes par le chef de la tribu qui le met en garde. L'utilisation prolongée de ces "armes-esprits" l'éloignera des monde des Vivants.
2. Baiser de sang
En réponse à la déclaration de guerre de Mercy, Mary, entourée de quelques hommes de Salem se rend aux Fosses pour obtenir vengeance. John, remis de ses blessures, décide de purger Salem de toutes les sorcières. Le Chaman l'avertit du grand péril qui l'attend et lui propose de renoncer et d'accompagner la Tribu vers des terres plus éloignées. John s'obstine et se voit offrir par les Indiens des armes et potions qui lui permettront d'approcher les sorcières sans être vu pour les tuer.
3. De l'intérieur
La Comtesse met en place un plan qui lui permettra d'obtenir davantage d'informations sur Mary Sibley. Pour ce faire elle attire une petite fille dans un puits et l’ensorcelle afin que celle-ci contamine les réserves d'eau des Sibley.
4. Le livre des ombres
Mary ignore les mises en garde de Tituba et donne des cours à Anne Hale, Mercy prépare sa vengeance contre Mary et Cotton rencontre le Dr Wainwright à son retour à Salem.
5. La mer profonde
Mary affronte enfin son ennemie jurée, la Comtesse Marburg, pendant que Hathorne menace Anne et essaie d'arracher le contrôle de Salem à Mary.
6. Traître clair de lune
La Comtesse Marburg arrive à Salem avec son fils, Sebastian. Alden est envahi par les émotions, Anne profite de ses pouvoirs et Cotton fait une confession.
7. Sous influence
Alors que Mary et la Comtesse Marburg continuent à lutter pour le pouvoir, Cotton fait une proposition et le Dr Wainwright se rapproche de la vérité sur le fléau.
8. Les oiseaux morts
Les habitants de Salem veulent être informés, Anne en apprend plus sur son père, Tituba essaie de convaincre Alden et Mary découvre l'histoire de la Comtesse Marburg.
9. Le salaire du péché
Mary fait un sacrifice pour protéger son fils de la Comtesse Marburg, les plans de Tituba tournent mal, Anne continue ses études obscures et une querelle brutale éclate.
10. Jusqu'à ce que la mort nous sépare
La Comtesse Marburg attend la comète qui concrétisera son triomphe, mais Mary met des obstacles sur sa route. Anne prend une décision fatidique et Cotton risque la mort.
11. Sur la Terre comme en enfer
Alors que Sebastian ne sait plus à qui se fier, Mary est dénoncée en public, et Cotton et Alden unissent leurs forces pour ébranler la Comtesse Marburg.
12. Que jamais minuit ne sonne
La vie d'Alden est menacée alors que le Messager des étoiles approche. Anne apprend une nouvelle choquante et Isaac se retrouve dans une situation délicate.
13. L'heure des sorcières
Alors que la Comtesse semble triompher, Mary prépare un dernier acte de défiance, Anne savoure son propre pouvoir et Mercy est menacée par un avenir incertain.