Saison 4

Grâce aux données envoyées depuis le réseau par Franz Hopper, Jérémie et Aelita parviennent à recréer une partie de Lyoko : le Cinquième Territoire.

Jérémie crée un spectre polymorphe à son image qui le remplacera en cours de sport. Il pourra ainsi plancher sur un moyen de ramener William de Lyoko.

Tout Kadic est en émoi : le batteur du célèbre groupe de rock Les Subdigitals va venir au collège !

Le foyer du collège est inauguré. C'est la réplique de William qui sera chargée de gérer ce nouveau lieu pour les élèves.

Jérémie et Aelita achèvent la création d'un vaisseau virtuel capable d'emmener les Lyoko-guerriers dans les tréfonds du réseau informatique mondial.

Sous la pression de Lyoko-guerriers impatients, Jérémie accepte de lancer le vaisseau virtuel Skidbladnir pour son voyage inaugural.

XANA a tendance à s'attaquer spécifiquement à Jérémie et Aelita. Jérémie s'en inquiète, car les autres ne savent pas utiliser seuls le supercalculateur.

Les Lyoko-guerriers repartent en mission dans la mer numérique pour explorer un nouveau monde virtuel que XANA semble avoir créé sur le modèle de Lyoko.

Jérémie s'est mis en tête d'entraîner les Lyoko-guerriers afin de lutter plus efficacement contre XANA.

En utilisant un satellite militaire, XANA parvient à détourner la trajectoire d'une comète, qui menace maintenant de s'écraser sur l'usine et le collège.

Pour enseigner un cours sur les écosystèmes, Mme Hertz emmène la classe de troisième camper sur une île isolée au milieu d'un lac.

Afin d'impressionner Milly en lui apportant un scoop, Hiroki tente de lui procurer le journal intime de sa sœur.

Les Lyoko-guerriers envisagent une mission de recherche et de destruction contre le supercalculateur qui a généré le premier Réplika.

Nos héros retournent dans le laboratoire d'Amazonie, bien décidés à détruire une bonne fois pour toutes le supercalculateur qu'il abrite.

Lors d'une mission de routine, Odd prend la décision d'emmener Kiwi sur Lyoko avec lui, contre l'avis de Jérémie.

Jérémie, embarrassé par le comportement de plus en plus humain de la réplique de William, fait part de ses craintes à ses amis.

Les Lyoko-guerriers retournent dans leurs familles respectives pour les fêtes de fin d’année... à l'exception d'Aelita, dont le passé reste un sujet douloureux.

Nos héros retournent vers la base du désert où ils font une découverte inquiétante, tandis qu'Odd semble être poursuivi par le mauvais sort.

Grâce à Odd, Jérémie gagne un baptême de l'air à bord d'un avion de chasse. Mais que se passerait-il en cas d'attaque de XANA ?

Sissi accueille sa correspondante venue d'Islande, un véritable canon qui rend fous tous les garçons du collège.

Les Lyoko-guerriers ne supportent plus Kiwi, le chien d'Odd. Ils décident donc de le laisser au labo pendant deux semaines.

Lors d'une inspection surprise des chambres, Odd supplie Yumi de cacher Kiwi chez elle. Pendant ce temps, Jérémie a repéré un nouveau Réplika.

Patrick, le cousin de Jérémie, débarque à Kadic. Contrairement aux autres Lyoko-guerriers, qui le trouvent très sympa, Jérémie ne peut pas le supporter.

C'est le grand soir : Aelita mixe en première partie du concert des Subdigitals !

Aelita découvre une photo d'elle en compagnie de Franz Hopper à l'Ermitage. Jérémie essaie d'en extraire des informations.

Lors de la visite des parents d'Odd, XANA passe à l'attaque en se servant des téléphones portables pour rendre leurs propriétaires particulièrement agressifs.

Tandis qu'Ulrich et Aelita affrontent un nouveau monstre virtuel géant indestructible, Odd et Yumi sont « translatés » vers une base en Sibérie.

Les Lyoko-guerriers retournent en Sibérie pour tenter de libérer définitivement William des griffes de XANA.

Ayant abandonné l'idée de détruire les Réplikas, Jérémie concentre à nouveau ses efforts sur les systèmes multi-agents.

Après leur victoire contre XANA, les héros se réunissent une dernière fois afin d'éteindre le supercalculateur pour de bon.