Saison 12

Un homme est retrouvé à Tempe, dans l'Arizona, avec de larges entailles en travers de l'abdomen. Le BAU souçonne immédiatement un tueur en série, qui s'est évadé d'une prison trois mois plus tôt. Luke Alvez, un nouvel agent, intègre l'équipe de Hotchner. Il a travaillé autrefois dans l'unité des fugitifs du FBI et avait déjà traqué et arrêté le tueur. Mais Reid, qui ne se remet pas du départ de Derek, peine à sympathiser avec ce nouveau collègue. Toute l'équipe est mobilisée par cette nouvelle mission. Mais, loin d'être inquiété, le criminel n'hésite pas à jouer au chat et à la souris avec les enquêteurs...

JJ, particulièrement fragilisée par une enquête en cours, s'effondre en rentrant chez elle. Elle explique à son mari comment l'équipe a traqué un pyromane qui mettait le feu à des adolescents, enlevés dans la ville de Los Angeles. Ses enfants étant malade, la nuit risque d'être difficile...

Emily Prentiss réintègre l'équipe de Hotch. Ses collègues n'ont que peu de temps pour se féliciter de son retour : ils sont appelés à enquêter sur la disparition de trois femmes en Floride...

L'équipe du BAU se rend en Virginie. Les policiers traquent un tueur en série qui sévit sur le sentier des Appalaches...

Le BAU se rend à Winona, dans le Minnesota, afin d'enquêter sur le meurtre de quatre membres de la famille Bergstrom, exécutés alors qu'ils dormaient. Seule Amanda, la fille, a été épargnée car elle ne se trouvait pas à la maison ce soir-là. Devenant la seule bénéficiaire de l'assurance vie des parents, Garcia la suspecte d'être mêlée à ces homicides. L'affaire se complique lorsqu'une deuxième famille est décimée de la même manière, laissant également un seul survivant, le fils aîné, bizarrement camarade de classe d'Amanda...

Trois enfants disparaissent alors qu'ils faisaient du vélo. Trente ans plus tôt, une disparition similaire a eu lieu au même endroit. L'équipe du BAU est chargée d'enquêter sur les deux dossiers...

Le BAU traverse une certaine accalmie et Prentiss prend ses marques comme chef d'équipe quand le Dr Lewis fait une expérience perturbante : alors qu'elle attendait son frère Gabriel avec qui elle est brouillée depuis des années, un inconnu est venu à sa place, affirmant être Gabriel et connaissant presque parfaitement sa vie. Ses coéquipiers découvrent alors qu'il s'agit d'un nouveau piège de M. Scratch.

Avec les multiples attaques de Scratch, Prentiss veut accélérer le recrutement d'un nouvel agent. Son équipe est appelée à Watika, dans l’État du Washington, où la disparition d'une prostituée a mené à la découverte de plusieurs corps de femmes tuées durant les trois années précédentes.

Une affaire personnelle revient à l'agent Rossi alors qu'il assure une formation à de futurs profileurs : le jour de son anniversaire, il reçoit l’appel d'un tueur en série qu'il a fait capturer mais qui compte reprendre ses meurtres brutaux et prévient Rossi.

L'unité du BAU part pour San Diego enquêter sur une série de meurtres : des couples sont abattus dans leurs maisons après que leurs demeures ont été envahies et saccagées.

Le BAU est appelé sur une affaire déconcertante : plusieurs personnes impliquées dans des œuvres de charité sont retrouvées mortes en pleine nature, marquées d'un dessin cryptique, après s’être apparemment donné la mort. Reid est obligé de rester chez lui, ayant décidé de prendre personnellement soin de sa mère malade.

Des torses d'hommes sont retrouvés abandonnés dans les rues de Palm Springs. L'identification des victimes est difficile mais le profil du tueur se dessine quand il commence à frapper la communauté gay.

À la suite d'une course-poursuite à Matamoros, Reid est arrêté par la police mexicaine en possession de drogue et de liasses de billets. Bien que l'équipe ne s'explique pas sa présence au Mexique et que les preuves l'accablent, son état de confusion et ses amnésies suggèrent un nouveau coup monté par Monsieur Griffes.

Prentiss retenue à Quantico alors que Reid se prépare à un éventuel procès, le reste de l'unité est appelé pour une série d'accidents de la route mortels perpétrés par un hacker qui a pris le contrôle des véhicules.

Reid a été transféré dans une prison où un gardien fait pression sur lui en menaçant de révéler aux détenus les plus dangereux qu'il est du FBI. Son équipe veut le soutenir mais ils sont appelés à Philadelphie où plusieurs personnes ont été aspergées d'acide.

L'équipe essaie de soutenir Reid avec les courtes visites mais une nouvelle affaire appelle le BAU : plusieurs femmes ont été retrouvées tuées les os broyés à travers New York. Alors que l’affaire s'ébruite, une femme vient voir la police, soupçonnant son fils d'être le tueur.

La situation de Reid en prison devient critique, battu et sans véritable protection. L'équipe du BAU doit cependant partir sur une affaire urgente : deux séries de meurtre ont lieu à Burlington, petite ville où la probabilité d'avoir deux tueurs simultanément est faible mais les différences entre les crimes sont trop nombreuses.

L'équipe est à la recherche d'une jeune fille disparue depuis 5 jours à New York, et qui fête son 16e anniversaire. Le BAU essaie de retrouver les victimes similaires, des adolescentes retrouvées vidées de leur sang et les os brisés. En prison, Reid doit faire face à un choix important : se soumettre ou tenter de détruire le réseau de drogue de la prison.

Tara, Emily et Walker tentent de s'occuper du cas de Spencer, pendant que le reste de l'équipe est sur une affaire en Arizona.

En quelques jours, plusieurs employés d'agences fédérales décèdent des suites d'une crise cardiaque. Parmi eux figure un ami proche de Walker. Le BAU enquête sur ces morts a priori naturelles mais cachent un moyen sophistiqué de tuer. Pendant ce temps, Reid attend anxieusement sa date de procès, et reçoit la visite de sa mère en prison, et également la visite surprise d'une femme venue du passé.

Quand Reid craint que sa mère ait été enlevée, il demande à ses partenaires du BAU d'enquêter afin de comprendre ce qu'il se passe derrière les indices qu'il possède. Pendant ce temps-là, Reid est toujours coincé en prison, tandis que son avocate, Fiona Duncan est de retour pour l'aider à préparer son procès. Le BAU confirme que Lindsey Vaughn a enlevé Diana Reid, mais qu'elle n'agit pas seul, et que la personne qui tire les ficelles et qui est derrière le meurtre de Rosa Medina, de l'incarcération de Reid et de l'enlèvement de sa mère n'est pas le dangereux Mr Scratch, mais la tueuse en série et l'ennemie juré de Reid, Cat Adams.

Reid se prépare à livrer une bataille sans merci contre son ennemi jurée Cat Adams. JJ et lui rendent visite en prison à Adams, qui est derrière l'enlèvement de sa mère Diana, avec sa complice Lindsey Vaughn et l'officier Lionel Walkins. Mais pour la sauver, il doit jouer un jeu mortel et décisif et en sortir vainqueur, ou sa mère mourra. Reid apprend que Cat est enceinte et elle affirme qu'il est le père. Après que la BAU a réussi à sauver Diana, Spencer Reid et Cat Adams s'admettent tous les deux qu'ils sont des psychopathes et qu'ils sont faits pour être ensemble. Reid admet qu'il aurait aimé que l'enfant soit de lui, mais il est en réalité de l'officier Wilkins, le complice qui a servi de contact entre les deux prisons. De leur côté, les profileurs du BAU ont la surprise de voir Derek Morgan revenir dans leurs bureaux. Celui-ci leur livre une piste sérieuse, qui devrait les aider dans leur traque de Mr Scratch, un tueur en série en cavale qu'ils ont déjà rencontré. Alors qu'ils partent et sont sur la route, les membres de la BAU sont percutés de plein fouet dans leurs voitures par un poids-lourd…